为了切实提升智库对“一带一路”建设的支撑力，更好贴近“一带一路”建设需求，细化、实化有关调研和对外交往工作，“一带一路”智库合作联盟将分区域、分领域设立智库联盟的分支网络，建立“六大经济走廊”、“澜湄合作机制”及“海上丝绸之路”国际智库合作网络，探索按地域、按行业领域建设智库联盟网络的模式，以提升智库联盟的务实性和有效性。
联盟秘书处经过广泛调研和沟通，初步确定由6家智库联盟理事单位作为“六大经济走廊”国际智库合作网络的牵头单位，3家理事单位作为“澜湄合作机制”国际智库合作网络的牵头单位，3家理事单位作为“21世纪海上丝绸之路”国际智库合作网络的牵头单位。具体如下：“中蒙俄”、“新亚欧大陆桥”、“中国—中亚—西亚”、“中国—中南半岛”、“中巴”、“孟中印缅”六大经济走廊国际智库合作网络分别由内蒙古自治区发展研究中心、中国人民大学重阳金融研究院、兰州大学、广西大学中国东盟研究院、蓝迪国际智库和云南省社科院牵头；“澜湄合作机制”国际智库合作网络由中联部当代世界研究中心会同深圳市发展研究中心、云南省社科院联合牵头；“21世纪海上丝绸之路”国际智库合作网络由广东国际战略研究院、大连海事大学和华侨大学共同牵头。各牵头单位负责具体联系相关国家主流智库，协同发展、共同打造“一带一路”智库合作升级版。